忍者杀手

ニンジャスレイヤー

ヤモト・コキ

ナンシー・リー

ダークニンジャ

ドラゴン・ユカノ

由佳乃的胸部很丰满

シルバーカラス

自由职业忍者。 是以平民为对象进行非法武器实战测试的「赛博辻斩」专家。「卡基·田中」是假名[注 42]，本名不详。 穿着戴上兜帽并扣上前襟便会自动装上防护面具的忍者装束。是精通任何武器的居合道达人，即使面对忍者也能压低风险进行辻斩的技艺高超的辻斩师。在一集动画中能与有名字的忍者多次战斗并获胜，实力非凡。 由于测试的是可靠性低的试作兵器，因此以一把名为「弃子」的平凡刀作为最后的依靠。弃子后来落入ヤモト・コキ之手。

ラオモト・カン

非法金融公司「猫杀基金」的CEO，同时也是暗黑经济组织“总屋”的首领，新埼玉地下社会的王者。

フォレスト・サワタリ

原「養老師散製薬 」的低階研究員 工作是捕殺在研究所內脫逃的生化忍者，在一次不意外的意外發生時，而被誕生自越南戰爭的忍者「阮氏・忍者」附身而變成忍者，變成忍者後他決定離職，同時解解放了公司中幾位生化忍者，建立起提倡「自由・生存・鬥爭」的生化忍者集團「倖存者道場」。 倖存者道場的生化忍者崇拜他為大將。佐渡自己將他們稱為自己的家人，雖然他們很瘋狂，但可以看出他們彼此非常親近。

ジェノサイド

由李・荒木領導的不朽忍者工作室（INW）的惡魔研究創造的殭屍忍者。

ラオモト・チバ

年仅12岁便担任猫杀基金CEO，同时也是其背后暗黑经济组织“天降派”年轻盟主的少年。 正如其名，他是罗莫托·坎的嫡子之一，继承了父亲的自大与笑声。

ヤクザ天狗

非忍者，既不是天狗，也不是妖精更不是黑道，而是黑道天狗 在「忍者殺手」誕生之前已經存在、孤高的忍者獵人，不斷獵殺忍者的聖戰士。

ナラク・ニンジャ

平安時代的忍者，身份、過去、經歷一切成迷的神話級忍者，連古事紀亦沒有任何紀錄的神秘忍者，與其他靈魂不同的是，它有著明確的自我，並低聲要求擁有者消滅忍者。

リー・アラキ

忍者灵魂研究部门负责人。 是Yoroshisan制药的异端分子，也是不朽忍者工坊的天才科学家。 利用“将忍者灵魂人为移植到普通人身上的技术”，负责将强大的忍者灵魂移植到阿玛库达里干部身上。也负责调查Y2K与忍者灵魂附身现象的关系。 他似乎只要研究安全得到保障就满足了，对教团并不十分合作。是“十二人”中唯一的非忍者。